肺鱼干扰素调节因子 1 基因(<italic>irf-1</italic>)的克隆及其在肉鳍类中的分子进化
摘要
肉鳍类是脊椎动物的重要类群, 分为总鳍鱼类和四足类. 其中总鳍鱼类现生的物种包括腔棘鱼和肺鱼. 四足动物则包括两栖类、爬行类、鸟类和哺乳类. 为了比较肉鳍类<italic>irf-1</italic> 基因的结构特点和系统发育意义, 本研究克隆了肺鱼<italic>irf-1</italic> 基因cDNA 全序列, 并与肉鳍类中其他物种的<italic>irf-1</italic> 基因进行了比对分析. IRF 是与自然免疫相关的蛋白质, 目前已发现了11 个家族成员, 其中<italic>irf-1</italic> 和<italic>irf-2</italic> 是最先被发现的2 个成员, 在天然免疫中起着重要的作用. 但有关IRF-1 的报道主要集中在哺乳动物, 其他类群中鲜有报道. 与已报道的<italic>irf-1</italic> 基因一样, 肺鱼的<italic>irf-1</italic> 基因可读框的前345 核苷酸非常保守, 在其C 端也含有1 个反式激活区(transactivationdomain)和1 个IRF 结合域2 (IAD2)的模体. 虽然肺鱼与四足动物最近的共同祖先距今有417个百万年之久, 但跨肉鳍类的序列分析显示, IRF-1 氨基酸及其基因序列在肉鳍类中都具有较强的保守性和显著的系统发育意义. 用IRF-1 氨基酸序列所构建的肉鳍类系统发育与已有报道的结果也是一致的.
引用本文(GB/T 7714)
小妮 甘, 绪祯 王, 新文 陈, 等. 肺鱼干扰素调节因子 1 基因(&lt;italic&gt;irf-1&lt;/italic&gt;)的克隆及其在肉鳍类中的分子进化[J]. Chinese Science Bulletin (Chinese Version), 2011.
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