应用比较基因组分析检测乙型肝炎病毒中可能的重组事件
摘要
应用生物信息学软件RDP3和Simplot及5种重组检测算法 (RDP, GENECONV, MaxChi, Chimaera和SiScan), 对791个人类乙型肝炎病毒(HBV)全基因组和38个非人灵长类乙型肝炎病毒全基因组序列进行了比较分析, 以检测可能的重组事件及重组子. 用RDP3检测出9个重组事件及61个重组子, 并用Simplot分析确定了具有两条亲代序列的6个事件中重组发生的位置. 61个重组子中53个为首次发现. 研究还表明PreC/C基因区域和基因边缘附近发生重组频率较高.
引用本文(GB/T 7714)
蓬 南, 琳 叶, 原 张, 等. 应用比较基因组分析检测乙型肝炎病毒中可能的重组事件[J]. Chinese Science Bulletin (Chinese Version), 2010.
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