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豹属线粒体基因组分析

孝兵 吴立新 诸磊 魏志刚 蒋

2011Scientia Sinica VitaeBiochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1开放获取

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摘要

采用PCR 扩增方法, 测定了虎、豹和雪豹线粒体基因组全序列, 长度分别为16990,16964 和16773 bp. 每个线粒体基因组包括: 13 个蛋白编码基因, 22 个tRNA, 2 个rRNA, 一个非编码的控制区(D-loop)以及一个轻链复制起点(OLR), 其基因组结构与家猫、美洲狮和云豹具有较高的相似性. 基于两组线粒体合并序列和线粒体全序列, 采用最大简约法、最大似然法及贝叶斯法(Bayesian)推测豹属的分子系统关系. 结果显示, 豹属(<italic>Panthera</italic>)由虎、豹、雪豹、美洲虎、狮和云豹组成, 云豹并归于豹属. 属内物种间的系统关系为: 云豹(虎(美洲虎(豹(狮,雪豹)))). 基于ML 最优树的枝长和4 个可靠的分歧时间校正点进行了分歧时间的估算, 豹属约在11.3 百万年前(MYA)从猫科动物中分化出来; 云豹、虎、雪豹和豹的分化时间分别为8.66,6.55, 4.63 和4.35 MYA, 比化石时间略早. 尤其是雪豹这一青藏高原的特有物种, 其分歧事件、演化过程、物种形成和分布模式与发生在8, 3.6, 2.5 和1.7 MYA 晚新生代青藏高原的地质构造事件及气候重大转型期呈现相关性.

引用本文(GB/T 7714)

孝兵 吴, 立新 诸, 磊 魏, 等. 豹属线粒体基因组分析[J]. Scientia Sinica Vitae, 2011.

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DOI:https://doi.org/10.1360/zc2011-41-9-699

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