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全反式维甲酸对SH-SY5Y细胞全基因组启动子区组蛋白H3乙酰化修饰的影响

洪波 方洋 米业 张珝琲 沈

2009Chinese Science Bulletin (Chinese Version)Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1开放获取

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摘要

为研究全反式维甲酸(all-<italic>trans</italic> retinoic acid, ATRA, 简称RA)诱导人类神经细胞分化的表观遗传调控机制, 应用染色质免疫沉淀与启动子芯片联合技术(ChIP-on-chip), 对RA诱导24 h后神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞中两万余个基因启动子区的组蛋白H3乙酰化修饰状态进行了高通量检测和分析. 首先分别制备RA处理组和对照组的标记探针, 然后将人类基因组启动子芯片与探针进行杂交, 获得RA诱导SH-SY5Y细胞分化早期全基因组启动子区H3组蛋白乙酰化的数据. 结果分析显示, RA处理导致597个基因启动子的乙酰化程度显著升高、647个基因降低. 本研究结果显示上述技术的高效与可行, 并为深入研究RA诱导分化相关基因的表观遗传调控机制奠定了基础.

引用本文(GB/T 7714)

洪波 方, 洋 米, 业 张, 等. 全反式维甲酸对SH-SY5Y细胞全基因组启动子区组蛋白H3乙酰化修饰的影响[J]. Chinese Science Bulletin (Chinese Version), 2009.

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DOI:https://doi.org/10.1360/csb2009-54-1-46

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