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跨膜蛋白结构预测新方法

晶 陈秀辉 刘兰 丁小泉 卢睿 王宏德 刘

2007Chinese Science Bulletin (Chinese Version)Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1开放获取

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摘要

基因组数据中大约有20%~30%的基因产物被预测为膜蛋白, 膜蛋白是一类具有重要生物功能的蛋白质. 预测膜蛋白跨膜区的数量和位置是生物信息学中重要的研究课题. 提出了一种预测膜蛋白跨膜区的新方法—— 连续小波变换极大值谱(MSCWT). 该法对8种SARS-CoV膜蛋白的预测准确度与常用膜蛋白预测软件TMpred相当, 对MPtopo数据库中131种新的已知结构的螺旋束蛋白(共包含548个跨膜区)的预测显示, 其跨膜螺旋区预测准确率为91.6%, 膜蛋白序列的预测准确率为89.3%.

引用本文(GB/T 7714)

晶 陈, 秀辉 刘, 兰 丁, 等. 跨膜蛋白结构预测新方法[J]. Chinese Science Bulletin (Chinese Version), 2007.

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DOI:https://doi.org/10.1360/csb2007-52-23-2742

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