糜子miRNAs的生物信息学预测及实验验证
摘要
microRNA是一类在转录后调控中发挥重要作用的非编码小RNA, 其靶标参与高等植物的发育、代谢、胁迫应答等生物学过程. 糜子是一类重要的禾谷类作物, 但目前还未见与其相关的miRNA报道. 通过基于表达序列标签和miRNA前体二级结构的同源搜索, 鉴定到43个新的miRNAs. 这些miRNAs不均匀地分布于11个miRNA家族. 利用psRNAtarget对这些miRNAs分析表明, 它们调控68个靶标基因. 11个miRNAs家族中的10个参与了RNA调控, 表明了它们在糜子转录后调控中的基本作用. 利用Northern blot对8个家族的miRNAs进行了鉴定, 表明本实验的预测方法是有效的.
引用本文（GB/T 7714）
卫星 单, 永军 武, 晓龙 王, 等. 糜子miRNAs的生物信息学预测及实验验证[J]. Scientia Sinica Vitae, 2012.
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