Endogenous viral elements in algal genomes
摘要
内长的病毒的元素(前夕) 是 host-genomic 碎片从病毒的染色体发源。他们在动物和植物染色体普遍被发现了。这里,我们执行了在海藻的染色体的系统的屏蔽和前夕的分析并且发现前夕通常在海藻的染色体存在。我们根据前夕碎片的长度分类 EVE 碎片进三个范畴。由于顺序类似的概率碰巧,我们忽略了中等长度的前夕碎片的潜在的功能。然而, longlength 前夕碎片可能有能力编码蛋白质域或甚至全部蛋白质,并且一些短长度的前夕碎片与主机 siRNA 序列有高类似并且可能服务了小 RNA 的函数。因此,短、长的前夕碎片可能提供 regulomic 和 proteomic 新奇给主人新陈代谢和改编。我们也发现几前夕碎片被超过 3 个海藻的染色体分享了。由分享的前夕和他们的相应种类的种系发生的分析,我们发现进主人染色体的病毒的碎片的集成是一个古老的事件,可能在 Chlorophytes 和 Ochrophytes 的分叉前。我们从病毒有经常的基因流动到海藻的染色体的调查结果表演。而且,海藻的前夕上的学习在大 timescale 使病毒主人相互作用清楚些并且能也帮助我们理解海洋的生态系统的平衡。
引用本文(GB/T 7714)
Wang, Liang Liang, Wu, 等. Endogenous viral elements in algal genomes[J]. 海洋学报:英文版, 2014.
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