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Metagenomics: Facts and Artifacts, and Computational Challenges

JohnWooley叶玉珍

2010Acta Scientiarum Naturalium Universitatis SunyatseniBiochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1

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摘要

Metagenomics 是从他们的自然环境直接取样的微生物引起的社区的学习,没有优先的 culturing。由包括许多(声发) 启用人口的分析 unculturable 和经常未知的微生物, metagenomics 正在革命化微生物学的领域,并且在能得益于环境微生物的学习的许多学科使研究人员激动,在生态学,环境科学,和 biomedicine 包括那些。特定的计算、统计的工具为 metagenomic 数据分析和比较被开发了。然而,新研究揭示了在限制在试验性的协议或不适当的数据分析过程引起的 metagenomics 数据在场的人工制品的各种各样的类型,它经常关于一个微生物引起的社区导致不正确的结论。这里,我们考察一些人工制品,例如种类差异和基因家庭频率的不正确的评价的 overestimation,并且讨论新兴的计算途径跟他们讲话。我们也考察 metagenomics 可以用下一代的定序的广泛的应用程序(NGS ) 遇到的潜在的挑战技术。

引用本文(GB/T 7714)

John, Wooley, 叶玉珍. Metagenomics: Facts and Artifacts, and Computational Challenges[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni, 2010.

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