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Genetic Diversity Analysis of Faba Bean （Vicia faba L.） Based on EST-SSR Markers

Minglun Gong、Ya-ming、Xu .、Sheng-chun、Mao Mao、Weihua、Li、Ze-yun

2011Acta Scientiarum Naturalium Universitatis SunyatseniAgricultural and Biological Sciences被引 24

摘要

Faba 豆子(Vicia faba L.) ，在世界上的最重要的荚之一，发展了栽培变种的不同类型由于它的部分跨授粉。简单顺序重复(SSR ) 的发展从表示顺序标签(EST ) 的标记为它的基因差异的调查提供了一个有用工具。现在的学习的目的是用 EST-SSR 标记从中国和欧洲调查 faba 豆子的基因差异。从 NCBI 数据库的 5 031 faba 豆子 EST 被下载并且集合进 1 148 unigenes。在 96 unigenes 的 107 microsatellites 的一个总数被识别，显示仅仅， 8.36% 序列包含了 SSR。在 faba 豆子以内的最丰富的 SSR 是 tri 核苷酸重复主题，并且在所有之中， tri 核苷酸重复主题 AAG/CTT 是最丰富的类型。把结果基于这些， 11 个 EST-SSR 标记被用来每地点与二～三等位基因从中国和欧洲估计 29 faba 豆子栽培变种的基因差异。多型性信息内容价值与 0.2919 的一般水准从 0.0644 ～ 0.4278 。主要并列分析(PCA ) 并且基于这 11 个 EST-SSR 标记的种系发生的聚类区分了这些栽培变种进不同的组。结果显示在中国的那粒 faba 豆子有一个狭窄的基因基础，并且基因栽培变种 / 就职的另外的来源应该被介绍提高基因可变性。这研究的结果证明 EST-SSR 标记在 faba 豆子 germplasm 的评估是很有效的。

引用本文（GB/T 7714）