水稻不完全隐性卷叶主基因<i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>的精细定位
摘要
利用奇妙香(QMX)为轮回亲本, 与卷叶珍汕97B(JZB)杂交并回交的BC<sub>4</sub>F<sub>2</sub>和BC<sub>4</sub>F<sub>3</sub>两群体为研究材料, 对卷叶性状进行了遗传分析, 并对卷叶基因进行精细定位. 遗传分析表明, 卷叶性状主要受1对不完全隐性主基因的控制, 命名为<i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>, 并同时受到数量性状基因和或环境的影响. 利用500个SSR标记和新开发的15个InDel标记, 通过BSA法在卷叶DNA池和平展叶DNA池间筛选到8个多态性标记, 并用MAPMAKER/EXP3.0构建遗传连锁图. 基因定位方法采用复合区间作图法(CIM). 利用BC<sub>4</sub>F<sub>2</sub>分离群体将<i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>初步定位于第2染色体长臂, 位于标记InDel 112~RM3763之间, 两标记之间的遗传距离为2.4 cM, <i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>距离InDel 112约1.0 cM. 为精细定位<i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>, 从BC<sub>4</sub>F<sub>2</sub>代经标记选择得到1个中度卷叶植株, 自交扩繁成855株个体的BC<sub>4</sub>F<sub>3</sub>代株系, 另发展4个新的InDel标记. 连锁分析表明, InDel 112.6和InDel 113位于标记InDel 112和RM 3763之间. 利用BC4F3株系中分离出的191个卷叶株和185个平展叶株, 将<i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>定位于InDel 112.6~InDel 113之间, 物理距离为137 kb. 对该区段进行了初步的侯选基因分析, 推测<i>rl</i><sub>(<i>t</i>)</sub>可能参与了microRNA(miRNA)系统对叶片发育的调控.