Vif-APO相关的HIV-1病毒模型
摘要
病毒感染因子Vif对控制HIV-1病毒的感染能力非常重要, 它通过和细胞抗病毒蛋白APOBEC家族(简写成APO)的相互作用, 引发APO的快速降解从而阻止APO被包装到新生的病毒粒子中. 在本论文中, 我们提出一个数学模型来定量地描述这种典型的病毒-宿主相互作用. 为检验该模型, 我们将计算模拟结果和4组已发表的实验数据进行了对比. 在此基础上进行了系统的参数敏感性分析和扰动分析, 表明与APO相关的参数对于新生HIV-1病毒粒子的感染能力非常重要. 我们发现病毒结构蛋白Gag的生成速率以及单位新生病毒粒子所需的Gag蛋白分子数目呈现出对高病毒粒子产生速率和低APO包装入新生病毒粒子程度的优化现象, 并且模型中的许多参数只在较小的取值范围内对病毒才是有益的. 我们还发现针对激活病毒RNA合成的调控蛋白Tat的小扰动会导致Vif和APO包装入新生病毒粒子的量呈现开关效应. 这些发现将有助于理解HIV-1病毒的高突变率和潜伏现象, 并为药物设计定位关键的靶标提供帮助.
引用本文(GB/T 7714)
懿 王, 鲁华 来. Vif-APO相关的HIV-1病毒模型[J]. Chinese Science Bulletin (Chinese Version), 2010.
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