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Computational Identification of Sweet Wormwood （Artemisia annua） microRNA and Their mRNA Targets

Alok Alok、Pani、Rajani Rajani、Kanta、Mahapatra、Niranjan、Behera、Pradeep Pradeep

2011Acta Scientiarum Naturalium Universitatis SunyatseniBiochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 6

摘要

尽管有它对疟疾的功效，在 Artemisia annua 的 artemisinin 的相对低的收益(0.01%-0.8%) 是到这药的商品化的严肃的限制。由外长、内长的因素的 artemisinin 和它的规定的 biosynthetic 小径的更好的理解是必要的改进 artemisinin 产量。增加的证据证明了 microRNAs (miRNAs ) 在各种各样的生物过程起多重作用。在这研究，我们对表示顺序标签(EST ) 从 Arabidopsis 和米饭使用了以前已知的 miRNAs A 的数据库。annua 将在 A 寻找潜在的 miRNAs 和他们的目标。annua。六潜在的 miRNAs 的一个总数被预言，它属于 miR414 和 miR1310 家庭。而且，八潜在的目标基因在这种被识别。在他们之中，七基因编码在 artemisinin 生合成起重要作用的蛋白质，包括 HMG-CoA reductase (HMGR ) ， amorpha-4,11-diene synthase (广告) ， farnesyl 焦磷酸盐 synthase (FPS ) 和细胞色素 P450。另外，为通常认为的 AINTEGUMENTA 编码的基因，涉及信号 transduction 和开发，也作为目标之一被预言。这在 silico 学习是第一显示 miRNAs 指向编码涉及 artemisinin 生合成的酶的基因，它可以帮助在 A 理解 artemisinin 生合成的调停 miRNA 的规定。annua。

引用本文（GB/T 7714）