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Phylomitogenomics of Malacostraca(Arthropoda: Crustacea)

ShenXinTian TianМэйYanBin-lunMichael Jen Jie ChuKahou

2015海洋学报:英文版Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1

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摘要

与定序的技术发展和 mitochondrial 染色体上的研究人员的不断的热情一起,染色体报导了的后生动物的 mitochondrial 的数字在过去的十年有巨大的生长。基于到对面现在可能的 mitochondrial genomic datais,大动物组织的种系发生的关系的 Phylomitogenomicsreconstruction。在类 Malacostraca 的甲壳纲的动物显示身体形式的高差异并且包括生态地并且商业地重要的种类的大数字。在这研究,在 Malacostraca 以内的种系发生的关系的全面、系统的分析基于从 GenBank 可得到的 86 个 mitochondrial 染色体被进行。在 86 个 malacostracan mitochondrial 染色体之中, 54 种类到 pancrustacean 的相同主要基因安排(排除的 tRNAs )扎根了模式包括从 Stomatopoda 的六种,从 Amphipoda ,二只鳞虾,从 Dendrobranchiata ( Decapoda )的七种,和从 Pleocyemata ( Decapoda )的 36 种类的三种。然而,报导的另外的 32 个 mitochondrial 染色体展出主要基因重新整理。发展史在几乎所有节点与百分之百以后的概率基于编码蛋白质的基因的核苷酸序列的贝叶斯的分析生产了一棵柔韧的树。结果一起显示那 Amphipoda 和 Isopoda 簇(Edriophthalma )(BPP=100 ) 。Phylomitogenomic 分析 Euphausiacea 在 Decapoda 以内被嵌套的强壮的支持,并且仔细与 Dendrobranchiata,它与从发展生物学的证据也一致有关。然而,从 Malacostraca 的 mitochondrial 染色体的分类采样很被偏导到顺序 Decapoda,没有染色体从 16 份订单中的 11 个报导了的完全的 mitochondrial。关于从许多 malacostracans 定序 mitochondrial 染色体的未来研究是必要的进一步阐明动物的这个重要的组的发展史。随可得到的 mitochondrial 染色体的增加, phylomitogenomics 将在生活研究的树上作为一个重要部件出现。

引用本文(GB/T 7714)

Shen, Xin, Tian Tian, 等. Phylomitogenomics of Malacostraca(Arthropoda: Crustacea)[J]. 海洋学报:英文版, 2015.

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