Expanded flux variability analysis on metabolic network of Escherichia coli
摘要
基于在一个细胞的有机体的集体能量守恒定律,流动平衡分析广泛地被采用了学习在细胞的新陈代谢的网络的结构和功能之间的相互影响。因而,新陈代谢的显型能很好被阐明。在这篇论文,我们介绍扩展流动可变性分析(EFVA ) 描绘新陈代谢的反应的内在的性质,例如灵活性,模块化和本性,由探索范围,最大值和反应的最小的流动的趋势。我们作为一个例子拿了 Escherichia 关口 i 的新陈代谢的网络并且在不同生长率限制下面分析了反应流动的可变性。当生长率增加时,所有反应的平均可变性戏剧性地减少。在新陈代谢的系统上考虑噪音效果,我们因此主张微生物可以实际上在一个非最优的状态下面成长。而且在 EFVA 框架下面,反应是容易被组织进分解代谢、 anabolism 的组。并且 anabolism 的组能进一步被分到特定的生物资源组成。我们也发现了反应的生长率依赖者本性。增补材料为在 10.1007/s11434-009-0341-x 的这篇文章是可得到的并且为授权的用户是可存取的。
引用本文(GB/T 7714)
Chen Chen, Tong Cheng, Xie, 等. Expanded flux variability analysis on metabolic network of Escherichia coli[J]. 中国科学通报:英文版, 2009.
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