A de novo transcriptomic analysis to reveal functional genes in Apolygus lucorum
摘要
自从 1997,生产 Cry1Ac 毒素的遗传上设计的棉花的普遍的种导致了显著地减少的杀虫剂应用。然而,因而绿 mirid 臭虫(GMB ) 的数字, Apolygus lucorum (Meyer-Dur ) 增加了。而不是棉花一种蛾的幼虫 Helicoverpa armigera (Hubner ) ,到目前为止, GMB 在转基因的 Bt 棉花领域里成为了主要害虫并且影响了棉花产量。不相称地,仅仅在分子的水平的 GMB 上的一些研究被报导了。从第三个中间形态美女和成年人的图书馆用 Illumina 技术被定序,突然生产超过 1.06 亿读并且集合了进吝啬的长度的 63029 unigenes 597 nt 和 N50 813 nt,从 300 nt 到 9771 nt。对 Nr 的 BLASTx 分析, Swissprot,去并且轮牙被执行注解这些 unigenes。作为结果, 26478 unigenes (42.01%) 匹配到已知的蛋白质并且 107 免疫者相关, 320 消化相关并且 53 变形相关的基因在这些注解 unigenes 被检测。另外,我们介绍了基因表示使用印射基于的差别在二个发展阶段之间的表示基因(DEG ) 策略:美女和成年人。结果证明几千基因是显著地,差别在不同发展阶段表示了。transcriptome 和基因表示数据提供了 GMB 的全面、全球的基因资源。这 transcriptome 将改进我们各种各样的内在的生物特征的分子的机制的理解,包括在 GMB 的开发,消化和免疫。因此,这些调查结果能帮助阐明 GMB 苏醒的内在的因素,为未来的出现新奇害虫管理目标转基因的棉花繁殖。
引用本文(GB/T 7714)
De-Pan, Cao, Yang, 等. A de novo transcriptomic analysis to reveal functional genes in Apolygus lucorum[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni, 2016.
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