基于网络药理学和分子对接技术初步探索“清肺排毒汤”抗新型冠状病毒肺炎作用机制
摘要
利用中药网络药理学和分子对接技术初步探索'清肺排毒汤'抗新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019，COVID-19）作用机制。结合中国药典（2015版）以及中药系统药理学数据库及分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology，TCMSP）、OMIM（Online Mendelian Inheritance in Man）、GeneCard、STRING等在线数据库，进行一系列网络构建、核心靶点筛选以及信号通路富集分析，最后对重要化合物进行分子对接预测。结果发现，清肺排毒汤化合物-肺炎靶点网络包含292个化合物和相应靶点214个，核心靶点涉及AKT1（AKT serine/threonine kinase 1）、IL6（interleukin 6）、MAPK8（mitogen-activated protein kinase 8）、MAPK1（mitogen-activated protein kinase 1）和JUN（jun proto-oncogene）等。应用GO（Gene Ontology）数据库功能富集分析得到858个GO条目，应用KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）数据库富集筛选得到122条有关通路，其中包含低氧诱导因子-1（hypoxia inducible factor-1，HIF-1）通路、Toll样受体（Toll-like receptors，TLRs）通路等已报道与肺炎相关的通路，也包括T细胞受体（T-cell receptor，TCR）通路等与肺损伤保护相关的通路。分子对接结果显示，清肺排毒汤中药材部分核心化合物对新型冠状病毒（2019-nCoV）的3C类似蛋白酶（3C-like protease，3CLpro）和血管紧张素转换酶2（angiotensin-converting enzyme 2，ACE2）蛋白具有一定的亲和力。本文初步探索了清肺排毒汤抗COVID-19的作用机制，且预测了其药效物质基础，期待本结果能为进一步确证清肺排毒汤抗COVID-19有效成分和作用机制提供帮助。