复杂的正选择压力驱动不同细胞嗜性HIV-1 的进化
摘要
对HIV-1 细胞嗜性的研究是理解HIV-1 传播和发病机制的关键. 通过对HIV-1 B 和C 亚型的R5 和X4 型病毒的全基因组进行适应性进化分析, 发现R5 和X4 病毒经历了不同的进化方式, 并且不同的HIV-1 基因受到不同的正选择压力, 意味着复杂的自然选择压力驱动HIV-1 的进化. 分析HIV-1 Gp120 超变区上的正选择位点, 发现相对于其他超变区, 更多的正选择位点发生在B 亚型X4 病毒的V3 区, B 亚型R5 病毒的V2 区以及C 亚型X4 病毒的V1 和V4 区域. 因为这些区域通常影响和决定HIV-1 的细胞嗜性, 更多的正选择发生在这些特定的超变区意味着作用于Gp120 上的选择压力与Gp120 的受体识别和结合功能有关. 值得注意的是, 无论是B 和C 亚型还是R5 和X4 型病毒, 显著更多的正选择位点发生在Gp120的C3 区域(33.3%~55.6%, P<0.05), 意味着C3 区对HIV-1 的生存和适应比先前认识的更为重要. 另外, 在R5 和X4 病毒的env 基因中, 约有一半的正选择位点是相同的, 尤其是Gp41 上的第96, 113 和281 位正选择位点均出现在所分析的4 种病毒类型中. 这些共同的正选择位点不仅意味着对病毒生存和适应的重要性, 也意味着R5 和X4存在交叉免疫源性位点的可能性, 这对于AIDS 疫苗的发展具有重要意义.
引用本文（GB/T 7714）
荣阁 杨, 克平 陈, 娜 丁, 等. 复杂的正选择压力驱动不同细胞嗜性HIV-1 的进化[J]. Scientia Sinica Vitae, 2011.
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