齐口裂腹鱼 HMGB 1基因克隆及其对嗜水气单胞菌胁迫的响应
摘要
为了解齐口裂腹鱼高迁移率蛋白B1 ( Schizothorax prenanti high mobility group box 1，SpHMGB1)的序列特征及其与嗜水气单胞菌胁迫的相关性，实验根据齐口裂腹鱼脾脏TSA库中获得的序列设计引物，采用克隆技术克隆 SpHMGB 1的核心序列并进行生物信息学分析，采用实时荧光定量PCR (qPCR)技术检测嗜水气单胞菌在体和离体胁迫后组织和巨噬细胞中 SpHMGB 1的响应情况。序列分析结果显示， SpHMGB 1开放阅读框长为615 bp，编码204个氨基酸，理论分子量为23.5 ku，等电点为6.79，包含2个基本的HMG盒：A盒和B盒，以及一个酸性尾巴。SpHMGB1二级结构主要由47.06%的α-螺旋和50%的无规则卷曲构成。系统进化树分析显示，SpHMGB1与鱼类HMGB1聚为一支，与斑马鱼和鲫的亲缘关系最近，氨基酸一致性分别为90.7%和90.4%。qPCR检测结果显示，嗜水气单胞菌感染后 SpHMGB 1具有不同的时空表达趋势，其中血液在72 h表达量最高，肾脏在6 h表达量最高，脾脏在120 h表达量最高；热灭活嗜水气单胞菌刺激巨噬细胞后， SpHMGB 1的表达量在0.5~24 h下调，24 h表达量最低，细胞因子 IL- 1 β 和 TNF-α 表达量均有上调趋势。qPCR检测结果提示，SpHMGB1可能参与齐口裂腹鱼细菌感染后的免疫响应。本实验可为进一步研究SpHMGB1在齐口裂腹鱼细菌性疾病中的免疫调节机制提供参考。
引用本文（GB/T 7714）
Hong Wang, Hong Wang, 彭爽, 等. 齐口裂腹鱼 HMGB 1基因克隆及其对嗜水气单胞菌胁迫的响应[J]. 未知来源, 2018.
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