全基因组关联研究中NanoDrop检测 D 260 / D 230 值在DNA质检中的意义

郭倩、Qian Guo、王赓、Geng Wang、殷健、Jian Yin、李梦梦、Mengmeng Li

2017Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1

摘要

目的探讨NanoDrop检测D260/D230值对全基因组关联研究（GWAS）中DNA标本质检的意义。方法收集1 494例强直性脊柱炎（AS）患者的血液DNA样本，分别用NanoDrop和PicoGreen检测样本浓度。第一阶段，对24例NanoDrop和PicoGreen浓度>50 ng/μL的DNA样本行Omni中华8芯片检测，比较16例芯片成功样本与8例失败样本的D260/D280值及D260/D230值。第二阶段，选取1 122例NanoDrop和PicoGreen检测浓度均大于50 ng/μL DNA样本行管家基因GAPDH的PCR检测，并对PCR反应成功的样本行Omni中华8芯片检测。采用Mann-Whitney U检验比较PCR反应成功与失败DNA样本的D260/D230值，采用受试者工作特征（ROC）曲线评价D260/D230值对PCR结果的鉴别效率。结果第一阶段中，芯片成功与失败样本的D260/D280值差异无统计学意义（P=0.444），而D260/D230值差异有统计学意义（Z=-3.920，P 结论在进行GWAS时，浓度及D260/D280值均较好而D260/D230值较低的DNA样本可能含有较多杂质，需联用PCR检测以确保样本质量；D260/D230值≥ 2.305时，样本纯度满足GWAS芯片检测的要求，可省略PCR检测。

引用本文（GB/T 7714）

郭倩, Qian Guo, 王赓, 等. 全基因组关联研究中NanoDrop检测 D 260 / D 230 值在DNA质检中的意义[J]. 未知来源, 2017.

引文网络

参考文献与被引分析加载中…

DOI：https://doi.org/10.16781/j.0258-879x.2017.11.1444

本站仅收录题录与摘要供学习参考，全文版权归属出版方；如有侵权请联系我们删除。