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hsa-miRNA-451靶基因预测及生物信息学分析

陈振娜、邵彦、李筱荣

2016Zhonghua yandibing zazhiMedicine被引 1

摘要

目的对hsa-miRNA-451进行靶基因预测及相关生物信息学分析。方法选择miRBase、miRanda、TargetScan、PicTar数据库或预测软件预测hsa-miRNA-451靶基因。对预测的hsa-miRNA-451靶基因的基因集合进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。采用Fisher精确概率法计算P值, P＜0.05为显著性阈值。结果至少3个数据库或预测软件预测到hsa-miRNA-451靶基因的靶点18个。功能富集分析预测的结果显示, hsa-miRNA-451靶基因主要参与上皮细胞增生、发育以及调节酶活性相关生物过程(P＜0.05)。信号转导通路富集分析预测的结果显示, has-miRNA-451靶基因显著富集于转化生长因子-β信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、表皮生长因子信号通路、Wnt信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路等(P＜0.05)。结论hsa-miRNA-451可调控与上皮细胞增生、发育相关的多个信号通路。

引用本文（GB/T 7714）

DOI：https://doi.org/10.3760/cma.j.issn.1005-1015.2015.06.022