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基于 rbcL -a和ITS的枸杞鉴别、遗传关系分析及ITS假基因的发现

陈金金Jinjin Chen赵明霞Mingxia Zhao姜树Jiang Shu曹丽丽Cao Lili

2017CAS OpenIR (Chinese Academy of Sciences)Agricultural and Biological Sciences被引 1

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摘要

<p>利用rbcL-a及ITS序列作为分子标记,对14个枸杞种或品种及1个伪品白刺进行了真伪鉴别及遗传关系分析。CTAB法提取总DNA,用通用引物对rbcL-a和ITS序列扩增、克隆、测序及分析,T克隆解决部分样品ITS无法成功测序问题。rbcL-a和ITS序列通用引物可在所有样品中成功扩增,rbcL-a序列全长643 bp,在14个枸杞种或品种中完全一致,与白刺具有45bp(7%)的碱基变异。ITS序列在14个枸杞种或品种中长度变异范围为513-692 bp。采用UPGMA法构建系统树,可区分白刺与枸杞,黑果枸杞和宁夏枸杞各品种分别聚为两支,云南枸杞、韩国枸杞及黄果枸杞则聚在宁夏枸杞大分支内。rbcL-a序列可有效进行枸杞真伪鉴别,ITS序列可用于枸杞品种鉴定及遗传关系分析。此外,本研究首次揭示了枸杞品种及个体内的ITS多态性,发现在枸杞中存在ITS假基因这一现象,为未来利用ITS序列进行枸杞系统进化研究提供一些新的参考。</p>

引用本文(GB/T 7714)

陈金金, Jinjin Chen, 赵明霞, 等. 基于 rbcL -a和ITS的枸杞鉴别、遗传关系分析及ITS假基因的发现[J]. CAS OpenIR (Chinese Academy of Sciences), 2017.

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DOI:https://doi.org/10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.05.018

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