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水稻F<sub>1</sub>花粉不育基因座<I>S-b</I>的精细定位

桂权 张、瑞珍 曾、文涛 李、泽民 张、效华 丁

2006Chinese Science Bulletin (Chinese Version)Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 3开放获取

摘要

杂种不育是水稻籼粳亚种间杂种优势利用的主要障碍, 开展杂种不育基因的克隆和功能分析对于克服和缓解亚种间杂种的不育性具有重要的意义. 本研究在<i>S-b</i>座位初定位的基础上, 根据水稻基因组的序列发展微卫星标记, 将<i>S-b</i>座位定位在微卫星标记PSM8和PSM202之间. 为了精细定位<i>S-b</i>座位, 以<i>S-b</i>座位的近等基因系为材料培育了包含有3910株的F2作图群体, 同时根据PSM8和PSM202界定范围内的基因组序列发展了2个微卫星标记, 2个插入缺失多态性标记和4个CAPS标记. 利用作图群体中的重组株进行花粉育性表型与新发展标记基因型的连锁分析, 结果表明标记W4与<i>S-b</i>座位完全连锁, 而标记A8和A14位于<i>S-b</i>座位的两侧, 与<i>S-b</i>座位的遗传距离分别为0.026和0.038 cM. 将多态性标记与该区域克隆的序列进行整合, 结果表明, 新发展的多态性标记锚定在了AC093089, AC079021和AC134931三个首尾相连的克隆上. 根据各标记在物理图谱上的位置, 最终将<i>S-b</i>座位界定在了A8与A14之间27 kb的物理距离内. RiceGAAS注释表明该区域有7个预测ORF. 该结果为<i>S-b</i>座位进一步的功能分析奠定了基础.

引用本文（GB/T 7714）

DOI：https://doi.org/10.1360/csb2006-51-4-404