基于第二代测序技术的条斑紫菜( Pyropia yezoensis )贝壳丝状体附生菌群研究
摘要
条斑紫菜（Pyropia yezoensis）贝壳丝状体黄斑病给育苗产业造成危害，但目前对健康状态下的菌群结构及其发病后变化仍缺乏认识。本研究基于第二代测序技术和16S rRNA序列分析，对健康和患病丝状体的细菌组成与变化进行比较。测序共产生1.6Gb配对末端序列，获得了第一个高通量的条斑紫菜贝壳丝状体细菌群落数据集。通过数据分析共识别出7，833种可操作分类单元（operationaltaxonomic units，OTUs），比对确定为18个细菌门。相对于健康样本，黄斑病丝状体样本的微生物多样性显著增加。主坐标分析和非加权组平均法（unweighted pair group method using arithmetic average，UPGMA）聚类均将健康和黄斑病丝状体分成不同的组，且健康组样本间的距离明显小于黄斑病组。上述结果说明，健康贝壳丝状体保持着相似的微生物群落结构，而患病后的丝状体则发生了不同的变化；健康样本和黄斑病样本组间差异显著的细菌属有39个，其中29个在健康样本中的相对丰度明显高于病患组样本。本研究从菌群生态角度分析了健康贝壳丝状体微生物菌群结构、发病后菌群的变化及其对丝状体生长的潜在作用，为丝状体病害的检测和预防提供有价值的信息。
引用本文（GB/T 7714）
盖珊珊, Gai Shan-Shan, 张卫东, 等. 基于第二代测序技术的条斑紫菜( Pyropia yezoensis )贝壳丝状体附生菌群研究[J]. 未知来源, 2016.
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