Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析
摘要
本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌<italic>Wolbachia pipientis w</italic>Mel基因组的密码子使用模式, 并推测影响其密码子组成的因素. 选择了478条蛋白编码基因作为研究对象, 它们的GC含量比较低, 约0.282~0.432. 本研究结果显示, 关联突变(context-dependent mutation)是影响W. pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素. 同时, Nc-Plot曲线显示, 基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性(nucleotide composition bias)的影响. 对应分析的结果显示, 基因长度(<italic>R</italic>=0.123, <italic>P</italic><0.01)和基因表达水平(<italic>R</italic>=-0.312, <italic>P</italic><0.01)也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用. 因此, 关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性. <italic>Wolbachia</italic>基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性, 而且现在已有报道说明它们有共同的起源, 但仍需进一步验证.
引用本文（GB/T 7714）
. Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析[J]. Science in China Series C-Life Sciences (in Chinese), 2009.
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