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鹌鹑VIPR-1的克隆、序列特征和组织表达分析

周敏、Li Sia Ying、沈栩、徐海平、张成广、张细权

2011Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 1

摘要

【目的】对鹌鹑血管活性肠肽1型受体（vasoacitve intestinal peptidetype 1 receptor，VIPR－1）cDNA全长基因进行克隆及分析，为鹌鹑的分子育种提供基础资料。【方法】通过比较基因组学，采用RT-PCR和RACE技术，获得鹌鹑了VIPR-1 cDNA全长序列；通过生物学软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对；采用实时定量PCR方法检测了VIPR-1在8个组织中的表达。【结果】鹌鹑VIPR-1的eDNA全长2427bp，包含了1341bp的开放性阅读框，编码446个氨基酸；序列分析显示，克隆获得的鹌鹑VIPR-1编码区序列与鸡该编码区序列存在41个碱基的差异，造成4个氨基酸残基的不同；VIPR-1氨基酸序列与鸡、火鸡、斑胸草雀的氨基酸的一致性分别为99．1％、92．2％、88％，与其它物种的一致性在60％-78％；各物种VIPR-1蛋白进化树符合物种进化规律；VIPR-1理化性质表明该蛋白为一偏碱性蛋白，蛋白二级结构主要由口一螺旋、β-折叠和β-转角构成；在N-端存在一个由22个氨基酸残基（MKsARLRVLLPLLGcLLSAASS）组成的信号肽，7个a-螺旋构成的跨膜域和C-端结构域，在跨膜域有胆固醇结合位点；在所检测的8个组织中VIPR-1，mRNA均有表达，在小肠中表达量最高。【结论】成功地克隆了鹌鹑VIPR-JeDNA全长序列，该基因在小肠组织的表达高于其它组织，在跨膜域存在胆固醇结合位点。

引用本文（GB/T 7714）

DOI：https://doi.org/10.3864/j.issn.0578-1752.2012.03.015