用生物信息学方法发现跨染色体剪接的嵌合5′/3′UTRs
摘要
mRNA的5′/3′ UTRs是在mRNA翻译过程中起重要调控作用的序列, 在5′/3′ UTRs上不正常的剪接模式可能导致多种严重疾病. 提出了一种基于大规模序列比对分析搜寻5′/3′ UTRs跨染色体剪接现象的方法, 并用此方法得到8例可信度高的跨染色体的5′/3′UTRs剪接事件, 从信息的角度证实了来自不同染色体序列剪接成为5′/3′ UTRs的现象是真实存在的. 对这8例跨染色体剪接产生的5′/3′ UTRs用多序列比对在剪接区域没有发现一致保守的motif. 同时, 目前的预测算法也不能在剪接区域检测到特异性的RNA二级结构, 因此很难确定引导5′/3′ UTRs跨染色体剪接的信号.
引用本文(GB/T 7714)
润生 陈, 治华 张, 巍 邓, 等. 用生物信息学方法发现跨染色体剪接的嵌合5′/3′UTRs[J]. Chinese Science Bulletin (Chinese Version), 2004.
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