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应用SELDI-TOF-MS技术初步建立结直肠癌I期分类树模型

范乃军、高春芳、王秀丽、盛新华、李冬晖、郑国宝

2009肿瘤Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 0

摘要

目的：分析结直肠癌Ⅰ期患者血清蛋白质组学变化,初步建立结直肠癌Ⅰ期分类树模型。方法：应用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪（surface-enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS）和固相金属螯合（immobilized metal affinity capture,IMAC30-Cu2＋）蛋白芯片检测血清样本得到质谱图,应用Biomarker Wizard软件对结直肠散发性中分化腺癌Ⅰ期31例和非癌组35例（其中健康志愿者16例,结直肠良性疾病患者19例）进行蛋白峰值鉴定和聚类。应用Biomarker Pattern软件分析得到分类树模型,在测试模式下行双盲验证。另外,应用电化学发光免疫测定法检测样本癌胚抗原（carcinoembryonic antigen,CEA）的表达。结果：软件识别了61个质峰,由质荷比为2 787、3 777、3 816、3 852、5 065、5 828、5 855和4 172等8个蛋白构成的分类树模型可以有效鉴别结直肠癌Ⅰ期与非癌组样本,在学习模式下敏感度、特异度分别是93.55%和91.43%,在测试模式下敏感度、特异度和阳性预测值分别是70.97%、82.86%和78.57%,明显优于CEA的检测,差异有统计学意义（P〈0.05）。结论：SELDI-TOF-MS检测得到的血清蛋白组分类树模型可以准确鉴别结直肠癌Ⅰ期与非癌组,对结直肠癌Ⅰ期的筛查有重要的意义。

引用本文（GB/T 7714）