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广东省PRRSV流行株的分离鉴定及其Nsp2、ORF3、ORF5基因的遗传变异分析

何锦玲、王晶钰、宋长绪、黄忠、蔡汝健、杨鼎

2009中国动物检疫Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 0

摘要

为了探究广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的流行情况，分析所分离毒株的分子遗传进化特征，本研究用RT—PCR方法对广东11个地区66个养殖场的189份病料进行了PRRSV的检测，结果表明，样本的PRRSV总阳性率为48．7％（92／189），其中变异株占63．0％（58／92）；阳性病例样本经处理后接种Marc-145细胞，成功分离到9株PRRSV。对分离到的9个毒株进行ORF3、ORF5基因和Nsp2主要变异区基因的扩增、克隆、测序和遗传变异分析。序列分析结果发现，其中2株Nsp2基因没有缺失，7株病毒的Nsp2基因发生了与高致病性PRRSV毒株相同的缺失，即第481位有一个氨基酸缺失，第532—560位有连续29个氨基酸缺失。同源性分析表明，分离毒株GDYF、GDZC、GDEP、GDSD、GDSH2、GDTHI、GDTH2与国内的HB-1（sh）／2002毒株及其它高致病性PRRSV同源性较高；GDX071108和GDSHI则与VR2332、RespPRRSVMLV、CH-1a的同源性较高，分离株之间的同源性为60．3％-100．0％。系统进化分析发现，GDX071108与PA8和RespPRRSVMLV的亲缘关系很近，与VR2332亲缘关系较近；而GDYF、GDZC、GDEP、GDSD、GDSH2、GDTHI、GDTH2则与JXA1、GO、HUB1、HUB2、HN2、HUN1、HNyz、HEB1、HUN4都在HB-1（sh）／2002的同一分支上。

引用本文（GB/T 7714）