大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选
摘要
目的测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列．对其基因进行功能和进化的分析，筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识。方法利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序，生物信息学方法进行序列拼接与分析，确定针对大肠杆菌O85的特异基因并设计引物，PCR方法进行模拟环境样品的检测。结果大肠杆菌O85的O-抗原基因簇序列全长为11203bp。发现8个开放阅读框架（orf）并确定功能，分别为：UDP-N-乙酰葡萄糖-2-异构酶基因（orf1），吡嘀型UDP-半乳糖交位酶基因（glf），糖基转移酶基因（orf3、orf5、orf6和orf8），O-抗原转运酶基因（wzx）和O-抗原聚合酶基因（wzy）。鉴定出针对大肠杆菌O85的特异基因2个和引物4对。结论本文筛选的特异分子标识和PCR检测方法可用于对环境样品中的大肠杆菌O85进行快速、灵敏的检测。
引用本文（GB/T 7714）
Wang Wei, Bin Liu, 刘雪倩, 等. 大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni, 2007.
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