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克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库的建立及应用

赵贵明刘洋陈颖杨海荣赵勇胜王娉

2014食品科学Biochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 0

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摘要

应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术建立了克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库,用于该菌属内种和亚种的高通量鉴定及菌株分型.在优化培养条件、样品处理方法及确定MALDI-TOF-MS蛋白质指纹图谱采集参数的基础上,将采集的8种参考菌株蛋白质质谱数据通过Biotyper软件构建克罗诺杆菌的MALDI-TOF-MS数据库,再用相近肠杆菌及该属分离株验证数据库的准确性.结果表明:应用建立的克罗诺杆菌的MALDI-TOF-MS数据库对135株克罗诺杆菌分离株进行分析,鉴定分值均不小于2.0,达到了种水平鉴定要求,通过聚类分析,可进一步分型.构建的MALDI-TOF-MS数据库为克罗诺杆菌高通量鉴定与分型提供了一种新的手段.

引用本文(GB/T 7714)

赵贵明, 刘洋, 陈颖, 等. 克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库的建立及应用[J]. 食品科学, 2014.

引文网络

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DOI:https://doi.org/10.7506/spkx1002-6630-201408020

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