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HLA-A^*0201限制性CTL表位肽分子力场分析

林治华王槐亮Li Jie龙海霞万谨王远强

2007Acta Scientiarum Naturalium Universitatis SunyatseniBiochemistry, Genetics and Molecular Biology被引 0

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摘要

运用比较相似性指数分析(CoMISA)方法研究了203个HLA-A^*0201限制性CrL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外30个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力.得到构效关系模型结果q^2=0.548,r^2=0.963,F=553.4,SD=0.154.在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型能得到明显改善.通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中30个CTL表位肽与HLA-A^*0201间的亲和力(rpred^2=0.532,SD=0.454).通过分析分子场等值面图在空间的分布,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽H与A-A^* 0201间结合亲和力的影响,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造,并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础.

引用本文(GB/T 7714)

林治华, 王槐亮, Li Jie, 等. HLA-A^*0201限制性CTL表位肽分子力场分析[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni, 2007.

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